Das Gen für die α-1.2-Fucosyl-Transferase 1 (verantwortlich für die Umwandlung der Grundsubstanz in die H-Substanz) ist auf Chromosom 19 lokalisiert (H- bzw. FUT1-Gen, 19q13.33). Die Gene für die N-Acetyl-Galaktosaminyl-Transferase und die Galaktosyl-Transferase und damit für die Blutgruppe A bzw. B finden sich auf Chromosom 9 (9q34.1 – 9q34.2).

Die Merkmale A (A1, A2) und B werden kodominant vererbt und sind dominant über das Antigen 0. Das Merkmal A1 ist dominant über das Merkmal A2. Daraus ergibt sich folgendes Vererbungsmuster:

Genotyp IGenotyp IIPhänotyp
A1A1A1
A2A2A2
A1A2A1
000
A10A1
A20A2
BBB
B0B
A1BA1B
A2BA2B